Villigen liegt im untersten Aaretal am Fuss des Geissberges. Es grenzt an sieben Gemeinden aus drei verschiedenen Bezirken. Mit der einzigartigen Dachlandschaft hat Viligen ein Ortsbild von nationaler Bedeutung.
Das Dorf ist mit 1036 Hektaren flächenmässig die grösste Gemeinde im Bezirk Brugg.
Von der Ruine Besserstein hat man eine herrliche Aussicht auf das Dorf. Somit kann man die vielen Reben entdecken. Der Weinbau hat hier eine grosse Bedeutung. Villiger Weine gelten als gute Landweine.
Weit herum gilt Villigen als das Dorf mit den schönsten Brunnen. 1583 errichtete man in der Gemeinde den ersten steinernen Brunnen, den Halseisenbrunnen.