Safenwil liegt eingebettet in der Quermulde zwischen den Unterläufen der Wigger und der Suhre. Es ist zudem gegen Westen abgeschlossen durch die Wasserscheide mit dem alten Strassenübergang "Striegel". Das Gemeindegebiet stösst im Norden an die Solothurner Kantonsgrenze, gerade dort, wo die Kalksteinschichten des Juras unter dem ausgedehnten Molassebereich unseres Mittellandes verschwinden.
Die Nähe der Städte Zofingen, Olten und Aarau, aber hauptsächlich die ringsum ausgedehnten freundlichen Erholungsgebiete und gepflegten Wälder mit hervorragendem Wanderwegnetz, machen Safenwil zu einem attraktiven Wohnort. Verkehrsmässig ist die Gemeinde durch die Nähe zweier Autobahnanschlüsse und die Bahnlinie Aarau-Zofingen ausgezeichnet gelegen. Die Nationalstrasse A 1 durchquert das Gemeindegebiet, und die A 2 führt in nächster Nähe vorbei.